Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMX3Q96JJ7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms