Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RBM17Q96I25 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RBM17Q96I25 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms