Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms