Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM3DQ96BQ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FAM3DQ96BQ1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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