Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLUAP1Q96AJ1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLUAP1Q96AJ1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms