Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC102AQ96A19 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms