Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NKD2Q969F2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NKD2Q969F2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms