Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED12Q93074 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED12Q93074 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED12Q93074 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED12Q93074 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED12Q93074 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED12Q93074 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MED12Q93074 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MED12Q93074 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED12Q93074 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MED12Q93074 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MED12Q93074 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MED12Q93074 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms