Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FRAT1Q92837 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FRAT1Q92837 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms