Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALLDQ8WX93 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALLDQ8WX93 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PALLDQ8WX93 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms