Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY6

MBD3L1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L1Q8WWY6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MBD3L1Q8WWY6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms