Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C4orf3Q8WVX3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms