Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX54Q8TDD1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDX54Q8TDD1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms