Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC44A5Q8NCS7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC44A5Q8NCS7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms