Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FSIP1Q8NA03 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms