Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSGALNACT2Q8N6G5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms