Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.981e-12■■■□□ 14.8
AGGF1Q8N302 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 220.88■□□□□ 0.931e-12■■■□□ 14.8
AGGF1Q8N302 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.081e-12■■■□□ 14.8
AGGF1Q8N302 C1orf109-202ENST00000461359 763 ntTSL 217.81■□□□□ 0.441e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 C1orf109-211ENST00000494120 2570 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.161e-7■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.141e-7■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 C1orf109-204ENST00000464178 812 ntTSL 48.95□□□□□ -0.981e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.424e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.414e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.284e-7■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 513.75□□□□□ -0.214e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 UBR4-205ENST00000417040 6175 ntTSL 512.72□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.734e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.424e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.324e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.294e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-215ENST00000450019 1689 ntTSL 523.01■■□□□ 1.274e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.24e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.074e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.074e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.944e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 516.51■□□□□ 0.234e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 04e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 STK26-203ENST00000394335 3017 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.142e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ITPK1-203ENST00000553452 609 ntTSL 524.48■■□□□ 1.518e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.978e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MUS81-213ENST00000530928 1793 ntTSL 220.08■□□□□ 0.88e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.688e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MUS81-207ENST00000529374 1232 ntTSL 519.15■□□□□ 0.668e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 319■□□□□ 0.638e-6■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.578e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.538e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 PAIP2-206ENST00000510409 815 ntTSL 218.32■□□□□ 0.528e-6■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 PAIP2-204ENST00000507755 776 ntTSL 518.14■□□□□ 0.498e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.418e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MUS81-202ENST00000524647 1817 ntTSL 517.55■□□□□ 0.48e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MUS81-211ENST00000530111 692 ntTSL 317.09■□□□□ 0.338e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.38e-6■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 316.76■□□□□ 0.278e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.198e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.178e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MUS81-204ENST00000525147 482 ntTSL 516.09■□□□□ 0.178e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.168e-6■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.058e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 PAIP2-207ENST00000511381 365 ntTSL 514.25□□□□□ -0.138e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ITPK1-206ENST00000554999 667 ntTSL 513.9□□□□□ -0.188e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.198e-6■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ITPK1-212ENST00000557309 770 ntTSL 312.93□□□□□ -0.348e-6■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.428e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MUS81-214ENST00000531905 3420 ntTSL 511.69□□□□□ -0.548e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.668e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ATF7-210ENST00000588232 531 ntTSL 410.89□□□□□ -0.678e-6■■■□□ 14.7
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AGGF1Q8N302 ATF7-201ENST00000420353 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.828e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ADGRV1-226ENST00000640083 1454 ntTSL 59.52□□□□□ -0.898e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 EPB41-208ENST00000460378 5212 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.928e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ITPK1-208ENST00000555553 727 ntTSL 39.31□□□□□ -0.928e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 39.03□□□□□ -0.968e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 28.88□□□□□ -0.998e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ATF7-209ENST00000588078 531 ntTSL 57.85□□□□□ -1.158e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ATF7-208ENST00000551480 473 ntTSL 56.62□□□□□ -1.358e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ADGRV1-204ENST00000504142 5047 ntTSL 56.48□□□□□ -1.378e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.798e-6■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.114e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.294e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 MTCO1P2-201ENST00000554243 703 ntBASIC9.05□□□□□ -0.966e-11■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.416e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 211.62□□□□□ -0.555e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 HERC1-209ENST00000560519 591 ntTSL 38.89□□□□□ -0.995e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.535e-7■■■□□ 14.7
AGGF1Q8N302 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 RAD51B-208ENST00000479335 1615 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.793e-6■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 RAD51B-204ENST00000469165 1158 ntTSL 38.84□□□□□ -0.993e-6■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 RAD51B-203ENST00000468382 829 ntTSL 58.2□□□□□ -1.13e-6■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 47.95□□□□□ -1.143e-6■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 RAD51B-213ENST00000492236 417 ntTSL 37.54□□□□□ -1.23e-6■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 RAD51B-202ENST00000460526 794 ntTSL 36.64□□□□□ -1.353e-6■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 HNRNPU-225ENST00000640119 461 ntTSL 511.45□□□□□ -0.581e-10■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 HNRNPU-218ENST00000639064 2625 ntTSL 59.48□□□□□ -0.891e-10■■■□□ 14.6
AGGF1Q8N302 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.795e-11■■■□□ 14.6
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