Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00518Q8N0U6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms