Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC103Q8IW40 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms