Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW8

SPNS2, Protein spinster homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2Q8IVW8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPNS2Q8IVW8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPNS2Q8IVW8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms