Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2Q1Q7Z7E8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms