Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms