Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SV2BQ7L1I2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SV2BQ7L1I2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms