Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SSH2Q76I76 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SSH2Q76I76 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms