Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C9orf139Q6ZV77 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms