Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM72Q6ZMU5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms