Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD4L3Q6VB84 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD4L3Q6VB84 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms