Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRSAM1Q6UWE0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms