Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTR9Q6PD62 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTR9Q6PD62 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms