Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPECC1LQ69YQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPECC1LQ69YQ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms