Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms