Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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FAM46CQ5VWP2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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FAM46CQ5VWP2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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FAM46CQ5VWP2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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FAM46CQ5VWP2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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FAM46CQ5VWP2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM46CQ5VWP2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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