Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AGAP9Q5VTM2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AGAP9Q5VTM2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms