Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms