Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC4Q5GLZ8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC4Q5GLZ8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms