Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNI3KQ59H18 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI3KQ59H18 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms