Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF6Q58WW2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 393.8 ms