Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SFT2D3Q587I9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SFT2D3Q587I9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms