Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC153Q494R4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC153Q494R4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms