Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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