Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UVSSAQ2YD98 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms