Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MICAQ29983 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MICAQ29983 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MICAQ29983 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MICAQ29983 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MICAQ29983 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MICAQ29983 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MICAQ29983 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MICAQ29983 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MICAQ29983 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MICAQ29983 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MICAQ29983 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms