Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUSP6Q16828 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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