Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMA3Q16787 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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