Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYPL1Q16563 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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