Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK5Q16478 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIK5Q16478 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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