Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC6Q16204 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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