Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TWIST1Q15672 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TWIST1Q15672 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TWIST1Q15672 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TWIST1Q15672 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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TWIST1Q15672 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TWIST1Q15672 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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TWIST1Q15672 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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