Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TAF13Q15543 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms