Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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